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营养与健康描述的血液中细胞特异性DNA甲基化的变化
发布时间:2020-10-30 20:49:52   来源:潮州视窗
 

  

最近,中国科学院上海营养与健康研究所(中国科学院科学与计算生物学合作伙伴研究所)的研究员Anrewteschendorff与研究员王思佳合作发表了一篇题为acell-typedeconvolutionmeta-analysisofwholebloodewasrevealslineage-specificsmoking-associateddnamethylationchangesOnlineonNatureCommunications的研究论文。

吸烟是一些复杂疾病的主要危险因素。表观遗传变化,尤其是DNA甲基化(DNaM)的变化,被认为是增加疾病风险的重要因素。大量现有的表观基因组关联研究(EWAS)通过绘制血液中DNA的变化来探讨吸烟如何影响正常细胞中的DNA甲基化。然而,血液是由许多不同类型的细胞组成的,因此尚不清楚哪些特定细胞类型更容易受到吸烟的影响。

该小组首次以细胞特有的方式对血液EWAS进行了Meta分析,以解决这一问题。研究人员收集并分析了7个独立的EWAS队列的dna甲基化数据,包括第一个对吸烟相关dnam变化进行全面分析的中国人队列。研究发现,与吸烟有关的dNaM的变化在很大程度上与种族无关,这支持了将多民族群体与Meta分析相结合的合理性。Meta分析进一步揭示了吸烟引起的血液中dNaM的大部分变化是如何在骨髓细胞中发生的,并且主要出现在炎症单核细胞和巨噬细胞的丹麦过敏部位。新发现的与吸烟相关的髓细胞特异性dNaM信号与急性髓系白血病有关。吸烟是急性髓系白血病的中度危险因素。然而,淋巴细胞中与吸烟有关的dNaM变化并不多。

在本研究中,细胞类型的dNaM变化是通过计算方法推断出来的,这为细胞特异性EWAS和元分析提供了范例,也为费力和昂贵的细胞分类提供了一种选择。Andrewteschendorff和王思佳是本文的合著者,博士生尤成龙是论文的第一作者。这项研究工作得到了中国国家自然科学基金、上海市级科技重大项目、国家科学技术基金会项目、国家重点研究开发项目和中国科学院战略科学和技术试点项目的支持。

纸链接

Meta分析显示,吸烟相关的DNA甲基化信号主要存在于髓系细胞中。

[资料来源:中国科学院工业网]

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